De Mondriaan Stichting hecht zeer aan een grondige verantwoording en evaluatie van met publiek geld gefinancierde projecten. Dat gebeurt op de volgende manieren:

Jaarverslag 
Jaarlijks wordt een gedetailleerd verslag gepubliceerd, met een beschrijving van alle ondersteunde projecten en een overzicht van alle bezwaren en alle niet-gehonoreerde en niet-behandelde aanvragen. Het annual report is een Engelstalige samenvatting voor internationale relaties.

Cultural Governance
Het bestuur van de Mondriaan Stichting houdt zich aan de Code Cultural Governance.

Externe evaluatie
Ook worden regelmatig externe evaluaties van beleid en praktijk verricht, zowel op organisatieniveau als in relatie tot het veld waarin de Mondriaan Stichting opereert. Jaarlijks worden bij voorkeur twee ondersteuningsmogelijkheden extern geëvalueerd.

Oriëntatiereis
Jaarlijks wordt van de oriëntatiereizen een gezamenlijk evaluatierapport gemaakt door de Mondriaan Stichting en het Prins Claus Fonds, dat zowel naar de ministeries van Buitenlandse Zaken en OCW en de Nederlandse ambassades wordt verzonden als breed in het veld verspreid.

Structureel klanttevredenheidsonderzoek en adviseursenquête 
Eenmaal per twee jaar evalueert bureau Motivaction werkwijze en imago van de Mondriaan Stichting. Voor dit onderzoek zijn 319 interviews, een respons van 22 %, online afgenomen. Om de kwaliteit van het beleid en de uitvoering daarvan te bewaken houdt de Mondriaan Stichting jaarlijks een enquête onder haar adviseurs. Als opmaat naar het ontwikkelen van het nieuwe beleidsplan zijn zowel in de adviseursenquête als in het Motivaction- nderzoek extra vragen opgenomen over de ontwikkelingen en behoeften in het veld. De uitkomsten van beide onderzoeken worden verwerkt in het beleidsplan 2009 – 2012.