Ook werkt de Mondriaan Stichting samen met Instituut Collectie Nederland en vereniging Digitaal Erfgoed Nederland. Het ICN heeft de Mondriaan Stichting geadviseerd over behoud van roerend erfgoed en met Den wordt overlegd over digitale duurzaamheid van projecten.

Cultuureducatie
Voor cultuureducatie vindt geregeld overleg en afstemming plaats tussen de Mondriaan Stichting en provinciale cultuureducatiesteunpunten zoals IVAK noordoost Groningen, Keunstwurk Leeuwarden, Kunst en Cultuur Drenthe en Kunststation C.

Lidmaatschappen
De Mondriaan Stichting is lid van vereniging Digitaal Erfgoed Nederland, Kunsten ’92, Nederlandse Museumvereniging en Voltage, een Europees netwerk van kunstorganisaties en fondsen. Ook maakt de Mondriaan Stichting deel uit van de stichtingsraad van de Stichting Internationale Culturele Activiteiten, informatie- en documentatiecentrum voor internationale sectoroverschrijdende aangelegenheden en belangenbehartiger voor internationale bovensectorale activiteiten bij de overheid.