De huidige ondersteuningsmogelijkheid is problematisch:

• Het algemene niveau van aanvragen is de laatste jaren teleurstellend. Veel aanvragen missen een theoretisch kader, een academische, onderzoeksgerichte benadering gerelateerd aan de museale praktijk en een heldere onderzoeksstrategie.
• Het aantal aanvragen is klein. De Mondriaan Stichting financierde in de afgelopen drie jaar maar vier onderzoeken. In 2007 werden slechts drie aanvragen behandeld. Dat roept vragen op over de behoefte van musea aan deze ondersteuningsmogelijkheid.
• Het merendeel van de onderzoeken die werden ondersteund verliepen traag. Dat komt onder meer doordat onderzoekers niet langer voltijds beschikbaar waren of meer materiaal werd ontdekt. Ook lieten publicaties lang op zich wachten. Om deze redenen besloot de Mondriaan Stichting maximaal een onderzoek per museum te ondersteunen. Dit heeft geresulteerd in een verbeterde, maar nog niet optimale uitvoering.
• Het financieren van collectiegericht onderzoek valt buiten de publieksgerichte doelstelling van de Mondriaan Stichting.

In het beleidsplan voor 2009–2012 zal over deze ondersteuningsmogelijkheid een besluit worden genomen.

Behoud van collecties 
De Mondriaan Stichting richt zich niet in de eerste plaats op het ondersteunen van behoudsprojecten. Wel beschikt zij over middelen voor het behoud van erfgoed dat is opgenomen op de lijst die hoort bij de Wet tot behoud van cultuurbezit. Daarnaast heeft het ministerie van OCW eenmalig extra middelen beschikbaar gesteld, nadat het bijzondere behoudsachterstanden had geconstateerd in een aantal collectiegebieden. Dat gold in 2007 voor het vormgevingserfgoed en het mobiele erfgoed.